硕士论文在提交前需要进行查重，万方查重是一种常用的查重工具。万方查重费用一般是按篇收费，费用较为合理。而多次查重则是指可以多次提交论文进行查重，有助于学生及时发现和解决论文中的抄袭问题。不同的是，万方查重费用较为固定，而多次查重可能需要额外支付费用。在选择查重方式时，要根据自身需求和经济能力进行权衡。

硕士论文万方查重费用与多次查重的区别主要在于费用和服务内容上。万方查重一般是按篇收费，费用相对固定；而多次查重则可以多次提交论文进行查重，但可能需要额外支付费用。在选择时，可以根据自身需求和经济能力来决定。万方查重费用相对较为合理，适合一次性查重；而多次查重适合需要反复修改和查找抄袭问题的用户。